新的计算机平台有助于将癌症患者与靶向治疗试验相匹配
随着越来越多的癌症患者对其肿瘤进行基因组分析,越来越多针对基因组改变的治疗方法进入临床试验,将患者与符合条件的试验联系起来的任务可能特别具有挑战性。丹娜-法伯癌症研究所开发的一个计算机平台使配对过程更容易、更快,其设计者在一项新的研究中报告说。
这个平台被称为MatchMiner,它帮助临床医生和临床研究人员根据患者肿瘤的基因变化,在患者和靶向治疗试验之间找到潜在的匹配。在Dana-Farber的五年时间里,它帮助大约五分之一的拥有MatchMiner基因组数据的患者同意加入精准医疗试验。该研究的作者发现,它还加快了20%以上的患者登记参加此类试验的过程npj精密肿瘤学.
“对患者肿瘤进行分析基因组的改变已经成为癌症治疗的广泛组成部分,特别是针对这些变化的新药进入临床试验或者被批准为癌症疗法,”Tali Mazor博士说,他和Dana-Farber的同事Harry Klein博士是这篇论文的共同主要作者。“越来越多的基因组数据和越来越多的精准医疗试验相结合,造成了一种脱节:为每个患者找到合适的试验可能是一项艰巨的任务。MatchMiner有助于弥补这一差距。”
该平台由Dana-Farber的知识系统小组开发,由Ethan Cerami博士和Michael Hassett医学博士领导,公共卫生硕士,利用Dana-Farber在基因组分析和临床研究方面的广泛项目。在过去的十年中,该研究所对超过4万名患者的肿瘤组织进行了400多个癌症相关基因的改变分析。该研究所及其合作伙伴领导或参与了数千项临床试验,包括自2017年以来涉及靶向治疗的约450项临床试验。MatchMiner于2016年推出,将这些系统连接起来,帮助患者匹配合适的试验。
克莱因表示:“肿瘤医生或其他临床医生可以使用MatchMiner为个别患者查找试验方案。”“或者,试验团队可以通过设置基因组过滤器,根据特定的基因组标准筛选候选人,来识别潜在的试验参与者。”
与大多数为单一癌症中心设计的匹配平台不同,MatchMiner是开源也可以被其他机构采用。当新的试验在Dana-Farber开放时,一名策展人会审查它们,看它们是否应该包含在MatchMiner中,以确保平台是最新的。截至2021年3月,有354个精准医疗试验被整合到MatchMiner中。
在这篇新论文中,研究人员分析了Dana-Farber医院精准医疗试验的注册数据,以确定MatchMiner是否加快了为肿瘤基因组分析患者寻找合适试验的过程。研究人员发现,在166个案例中,该平台确定了患者和试验之间的潜在匹配,试验团队或患者的肿瘤医生查看了匹配,导致患者同意参加试验。
为了进一步评估该平台的影响,研究人员比较了通过MatchMiner获得的166份同意书和没有该平台获得的353份同意书的“同意时间”(从肿瘤基因分析到患者同意参与试验之间的时间)。Klein说:“我们发现使用MatchMiner组的用户同意时间比不使用MatchMiner组的用户快55天,提高了22%。”
MatchMiner不仅通过患者肿瘤的分子特征,还通过患者的年龄和肿瘤类型将患者与试验联系起来。其他试验标准,如肿瘤在患者-试验匹配中,不考虑分期、既往治疗和患者整体健康状况。因此,研究人员说,MatchMiner提出的匹配是初步的,需要进行后续研究,以确保患者满足所有的试验标准。
Mazor说:“MatchMiner为那些肿瘤已经确定基因改变的患者找到合适的试验提供了一个起点。”她补充说,该平台的设计师将努力扩大其功能,以实现更全面的匹配。通过与Kenneth Kehl医学博士、公共卫生硕士的合作,MatchMiner正在测试基于人工智能的预测,以更好地识别可能很快需要新的治疗方案(如临床试验)的患者。
进一步探索
其他机构也可以采用MatchMiner。更多信息请访问matchminer.org.