“CAR池”筛查可以识别最有效的癌症免疫治疗细胞

“CAR池”筛查可以识别最有效的癌症免疫治疗细胞
生成和筛选具有不同信号域的car池库。(A)我们的CARs结合了一个αCD19 ScFv (FMC63),一个CD8铰链和跨膜结构域(TMD),一个细胞内信号结构域和一个CD3ζ结构域(左)。来自人类蛋白质组的40个结构域被密码子优化、合成、汇集到一个质粒库中,并打包生成慢病毒(右)。这些跨蛋白质家族,如免疫球蛋白超家族(IgSF);T细胞/跨膜、免疫球蛋白和粘蛋白(TIM);TNF受体超家族(TNFRSF);触发髓细胞(TREM)上表达的受体。(B)显示文库成员在免疫细胞类型中的自然表达的维恩图。表达式模式列在表S1中。NKT,自然杀伤T细胞; DC, dendritic cell. (C) Primary human CD4 and CD8 T cells were separately isolated from PBMCs for two human donors and lentivirally transduced with the library. The cells were FACS-purified using T2A-GFP fluorescence within one log of mean expression to reduce variability. (D) The pooled library was repeatedly stimulated 1:1 with CD19+或CD19照射K562肿瘤细胞以量化抗原特异性活化(CD69)、细胞因子产生(IFN-γ和IL-2)和增殖[CellTrace Violet (CTV)]。该库也在指定的时间点进行测序,以测量单个结构的相对扩展。(E) CD8百分比+在CD19重复刺激试验后,T细胞表达不同数量的衰竭标志物(PD1, TIM3, LAG3和CD39)+照射的K562肿瘤细胞。表达CD28, 4-1BB或CD3ζ-only CARs的T细胞与未转导的(Untrans.)细胞进行比较。灰色的盒子对应着没有活细胞存活的时间点。使用重复测量ANOVA模型评估了两名供体CD8 T细胞的显著性。fdr校正*P = < 0.05, ***P = < 0.001;Ns,不显著。第二个供体和CD4数据+T细胞如图S1 (A和B)所示。(F)我们使用FlowSeq,一种FACS和下一代基于测序的池化量化工作流程,通过将文库分类为与功能读数相对应的荧光信号箱来量化富集,如彩色直方图所示。然后,我们通过基因组DNA提取和PCR扩增共刺激结构域,并对每个bin进行扩增测序,以估计每个文库成员的表型。信贷:科学转化医学(2022)。DOI: 10.1126 / scitranslmed.abm1463

近年来,基因改造的免疫细胞——装备分子武器来识别和摧毁肿瘤细胞——已经改变了癌症治疗的前景。现在,加州大学旧金山分校的研究人员开发了一种新方法,可以比较大量的这些CAR-T细胞,每个细胞的分子特征略有不同,以确定哪种对癌症最有效、最持久。

他们在2022年11月9日发表的研究中科学转化医学在美国,该团队使用了一种被称为“CAR Pooling”的方法来研究40种不同的CAR- t细胞.在未来,这个屏幕可以扩展到测试数百或数千种受体组合,已经发现了新的和令人惊讶的受体,使这些治疗细胞更强大。

“CAR-T细胞对许多血癌患者来说绝对是革命性的,”资深作者、加州大学旧金山分校微生物学和免疫学副教授、格莱斯顿-加州大学旧金山分校基因组免疫学研究所成员Kole Roybal博士说。“这项工作是一个垫脚石,我们将以更聪明的方式设计这些细胞,让它们在更多类型的癌症中更好、更持久地工作。”

变革性治疗

T细胞是一种白细胞,在其表面表达受体,识别体内的外来物质。当一个匹配的分子或粒子适合T细胞受体时,细胞就会启动一个为了抵御侵略者。这种反应不仅可以消灭病毒和细菌,而且还可以

当癌症患者接受CAR-T细胞治疗时,临床医生从患者的血液或健康的供体中收集T细胞。然后,他们在实验室里改变这些细胞,加入DNA来诱导在其表面产生特殊的癌症识别嵌合抗原受体(CARs)。改造后的细胞被培养出来并注射回患者体内。新的car帮助T细胞特异性地攻击癌细胞。多种CAR-T细胞已被批准用于血癌,包括淋巴瘤、白血病和多发性骨髓瘤。

加州大学旧金山分校博士后学者、这项新研究的共同第一作者丹尼尔·古德曼博士说:“我们能够将T细胞从体内取出,向它们添加新的遗传程序,并将它们作为一种活的可编程疗法放回体内,这已经对血液癌症的治疗产生了巨大的影响。”“然而,如果我们更充分地了解如何操纵工程细胞的信号和功能特性,这只是工程细胞能力的开始。”

研究人员一直在努力让CAR-T细胞对抗实体肿瘤。即使对许多血癌患者来说,CAR-T细胞也只是暂时起作用,或者根本不起作用。

开发新的CAR-T细胞疗法的限制因素之一是修改和测试新受体所需的高通量技术;在整个免疫系统中,有数百个受体片段,它们可以像乐高积木一样组合成数千种可能的组合。

简化T细胞测试

Roybal、Goodman和共同第一作者camilia Azimi开发了CAR Pooling,以一次快速测试不同CAR的有效性。这种筛查的工作原理是生成一个包含许多免疫受体遗传密码的DNA库,同时将它们引入数百万个细胞,然后让这些细胞在试管中竞争它们在生存、生长、识别和摧毁癌症方面的技能。

“我们的方法使测试基于受体的新疗法的过程更快,”当时在加州大学旧金山分校读研究生的阿兹米说。“这不仅可以让研究人员节省时间,还可以探索他们无法单独测试的设计。”

例如,在这项新研究中测试的40种car中,不仅有经典的t细胞受体,还有从其他类型的相关免疫细胞借来的受体。例如,一种名为BAFF-R的b细胞受体是使T细胞特别有效地对抗癌症的主要竞争者。

Azimi说:“如果我们没有使用CAR Pooling,我们永远不会选择测试BAFF-R。

当含有BAFF-R的CAR-T细胞在患有多发性骨髓瘤的小鼠中进行测试时,与接受标准CAR-T细胞的小鼠相比,这些小鼠存活时间更长,患癌症的几率更低。

未来研究的平台

研究小组正计划扩大CAR - Pooling的应用,以测试再造T细胞中更多的受体。Roybal说,最终,这种方法可以用于开发针对不同类型癌症的不同种类的CAR-T细胞;当涉及到不同的癌症类型时,可能没有一个通用的答案。

他说:“我们当然可以使用CAR - Pooling来快速找到适合特定临床环境的最佳受体。”“一组受体可能对胶质母细胞瘤更有益,而另一组受体对骨髓瘤最有益。”

随着研究人员筛选越来越多的免疫受体,他们希望揭示受体如何支配免疫细胞活动的潜在模式。最终,这可能会导致更多的合成受体,可以接受不仅,但其他疾病。

古德曼说:“我们希望了解如何组成这些信号域的基本部分,并建立下一代工程细胞疗法。”

该实验室还致力于了解和改进CAR-T细胞受体之外的其他方面,以提高治疗的有效性。

“有很多方法可以修改这些细胞,”Roybal说。“这只是拼图的一部分。”

更多信息:Daniel B. Goodman等人,CAR - T细胞的联合筛查为下一代免疫疗法确定了不同的免疫信号域,科学转化医学(2022)。DOI: 10.1126 / scitranslmed.abm1463
期刊信息: 科学转化医学

引用:“CAR池”筛选识别最有效的癌症免疫治疗细胞(2022,11月10日)检索自2022年11月12日//www.puressens.com/news/2022-11-car-pooling-screens-effective-cancer.html
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