下水道侦查、空气科学家密切关注COVID-19吸尘
大卫·奥康纳认为粪便可以告诉你很多关于你自己和你周围的人有科学支持他。
而从废水样品分析数据收集的威斯康辛州国家卫生实验室今年早些时候,奥康纳和他的同事们检测到一个高度突变导致COVID-19版本的病毒称为神秘的血统。一些谨慎科学的侦查,他们能够跟踪单个源的血统。
好奇是什么神秘的血统是,通过一些未知的过程,他们开发同样的基因突变发现变异的问题,像买卖,尽管没有被这些或相关菌株的后裔。科学家们感兴趣的研究这些血统,这可能是下一个主要的起源COVID变体和普遍的感染。
”怎么可能一个人的病毒进入废水有许多相同的变化,把(ο变体)过去两年的算出它传遍世界吗?这是巨大的问题我们想弄清楚,”O ' connor说,病理学和实验室医学系教授威斯康星大学麦迪逊分校。
这就是为什么他和他的团队是如此热衷于追踪血统他们发现回到源头。他们的研究成果发表的一项研究的主题之前,同行审查medRxiv 11月1日,最近一篇刊登在的焦点自然今年9月。
“就像CSI下水道,”O ' connor解释道。“我们有一个人孔位置在哪里(地图废水样品起源),所以我们会尽量选择哪些战略将使我们狭窄的来源。”
通过消除负面的样本的神秘血统和跟踪积极的在地图上人孔,团队可以确定具体的办公大楼的血统被驱逐出境。团队的目标是测试办公室工作人员在大楼里,看看他们是否可以确定个人的独特的病毒。
如果他们可以可以找到这个人,他们可以更好地了解传染性神秘血统可能和肠道外能否生存环境。
但是这样做需要办公室员工志愿者自己进行测试。一些建筑工人同意鼻抽汲,但是研究人员还没有看到相同的神秘血统的样本。
提出了几个问题:是个体的神秘的天堂不是一个工人自愿鼻拭子吗?是浪费的病毒检测而不是在鼻腔通道?或者,是个人甚至脱落病毒了吗?
追踪个人的下一步是办公室工作人员收集粪便样本。
找到这个神秘家族在威斯康辛州也使得奥康纳想知道有多少人在全国和世界有类似的突变,水平未知的传染性。他说,他可以想象一个世界,常规废水监测存在的基础设施,给科学家参与社区感染率没有依赖个人测试。
毕竟,COVID疲劳是真实的。许多寻找PCR检测的人越来越少,也许为了避免brain-scraping鼻拭子的感觉,因为他们发现测试可用性在他们的社区或更少,和许多人一样,因为他们转向一个流行后的心态。
因为它不现实期望每个人都在一个社区来测试,被动社区测试像废水采样提供了一种快乐的媒介。同样,可能另一个被动的方法:吸尘的漂浮在空中。
大卫•奥康纳大厅对面的另一位研究员的实验室正在研究呼吸道病毒可能会发现在空气中在学校和养老院。满足谢尔比奥康纳,病理学和实验室医学系教授威斯康辛大学麦迪逊分校,也是嫁给了大卫。
通过与热费希尔的合作始于去年,谢尔比的实验室已与大卫的合作使用AerosolSense工具监控存在COVID-19吸收空气和陷阱的东西漂浮在泡沫墨盒。
到目前为止,他们已经放置设备公立学校威斯康辛大学麦迪逊分校、疗养院和大卫的讲座类,他们收集空气一两天,吞噬病毒和其他漂浮。
回到实验室,O ' connor和他们的团队用溶剂将所有捕获的海绵管。
由于空气取样装置收集的不仅仅是病毒,然后研究人员进行测试,看看潜在的病毒存在的问题和工作来识别的。
通过这一过程被称为测序他们这么做,他们看的基本构建块中可能存在的病毒遗传物质样本,称为核苷酸,它们的顺序串在一起。命令字符串可以被用来识别病毒团队所看到的样品。
测序可以用来专门寻找COVID-19还要缩小和识别其他呼吸道病毒,像流感或其他未知病毒,可能出现在空中。能够看到具体和广泛给研究人员可能监控这些位置的空气的病毒可能导致未来的暴发。
“有趣的是我们已经看到不同的病毒出现在不同的人口,”谢尔比说。”例如,在大学校园里,我们看到流感在2021年晚些时候,但在我们周围的k - 12学校运行这些采样,我们没有看到流感。”
策略性地放置这些设备可以帮助高危社区准备潜在的疾病暴发,允许他们在疗养院采取缓解策略,帮助病人安全,学校开放。
他们进一步的研究也提供了一个机会,跟踪和了解当地的感染率数据。例如,研究人员可以创建一个仪表板为特定的建筑物和临街的房间,如机场,所以人们访问或经过可以更好地了解他们的接触各种病毒的风险。
大卫和谢尔比的中心主题的研究围绕着进行科学,使非科学家数据可行的和有效的。尽管COVID疲劳,谢尔比和大卫的团队一直与其他科学家和社区合作伙伴。
“我认为这是很好的,当我们开始工作的人也一样兴奋地互相帮助。这是真的很高兴看到有多少人可以社区主导型,通过这一过程,”谢尔比说。
O ' connor的理想世界里,空气取样设备将在每一个机场和下水道系统,不断地收集数据并帮助公众保持更了解疾病的风险。
但是,尽管这些技术正在远离科幻小说每天和接近现实,O’connor强调,重要的是为人们继续使用有效的缓解工具我们已经预防呼吸道疾病如COVID-19和流感的传播。面具,经常洗手,呆在家里,如果你感觉不舒服和保持最新的疫苗都是人们可以采取措施保护自己和对方。
“你仍然不得不承认风险在特定情况下,”谢尔比说。“即使科学家们正在做他们的差距预测最好的,它仍然是生物学。有些事情我们无法控制,所以你还是要照顾好自己。”
伊文·卡拉威,这些科学家追踪一个新的冠状病毒家族通过污水,自然(2022)。DOI: 10.1038 / d41586 - 022 - 02996 - y