研究人员绘制了与前列腺癌相关的遗传基因变异的活动
德克萨斯大学西南分校的研究人员已经确定了87种影响前列腺癌风险的遗传基因变异的分子功能,其中大多数似乎控制着远离风险变异本身的基因的活性。该研究结果发表在癌症的发现这项研究的作者说,这项研究可能会带来更好的评估癌症风险的方法,以及抗癌药物的新靶点。
“传统上,我们认为基因组中的调节元件影响邻近基因,”研究负责人Ram Mani博士说,他是UTSW病理学和泌尿学助理教授,也是Harold C. Simmons综合癌症中心的成员。“但这些风险变异,或风险等位基因,可以像电灯开关一样发挥作用。灯在天花板上,但开关在房间另一边的墙上。”
他说,研究结果还表明,一个个体的风险等位基因可以调节多个基因。
前列腺癌癌症是最具遗传性的癌症之一,马尼博士解释道。研究人员已经发现了至少185种常见的前列腺癌症的风险等位基因,或DNA片段,在欧洲血统的家庭中代代相传。但由于这些等位基因绝大多数位于DNA的非编码区(不含基因,因此不产生蛋白质),它们如何影响前列腺癌风险在很大程度上是一个谜。
之前的研究表明,他们可能会控制基因调控但哪些基因受到了影响,它们的活动是如何改变的,目前尚不清楚。为了回答这些问题,马尼博士和他的同事们使用了几种方法来确定哪些基因是风险等位基因的目标。一项利用565个前列腺癌肿瘤数据的三维测绘技术显示,这些风险等位基因中有87个影响数百个基因的活性。
虽然恶性肿瘤通常出现在前列腺上皮细胞中,研究人员发现受影响的基因通常存在于其他组织类型中,包括基质细胞而且平滑肌细胞支持上皮细胞。大多数风险等位基因似乎改变了这些基因的活性,这些基因产生的蛋白质已知参与了发育、凋亡(程序性细胞死亡)和代谢的分子途径,以及其他细胞过程。
马尼博士说,一些等位基因在它们控制的多个基因上具有相反的活性。例如,一个名为rs8102476的等位基因同时增加了一个基因的活性,同时降低了邻近基因的活性。风险等位基因也有显著交互作用基因获得了与前列腺癌相关的非遗传突变;这些相互作用似乎可以预测患者病情的恶化程度。
马尼博士说,这些发现可能会为患者带来更好的风险模型,以及新的前列腺癌治疗方法。他补充说,迫切需要进一步的关联研究,以确定非欧洲血统人群中的风险等位基因,以便为更广泛的患者群体定制风险模型和治疗方法。
“非裔美国男性患癌症的风险较高前列腺癌尤其是侵袭性疾病,”马尼说。“迫切需要对这些人群和其他存在健康差异的人群进行更多的全基因组关联研究,以了解他们风险的本质,以及如何降低风险。”