研究表明，一些先前存在的RSV谱系推动了2022年病毒的激增

去年年底，美国各地有数千名儿童因呼吸道合胞病毒(RSV)而住院，但与之前的RSV激增不同，这次感染的人数更多，年龄范围更广，包括年龄较大的儿童。随着病例在这个季节比前几年上升得更快、更早，研究人员想知道快速传播的RSV变种是否会导致这种不寻常的病例模式。

为了了解导致病毒激增的原因，来自麻省总医院(MGH)及其在大波士顿地区的门诊诊所的科学家和临床合作者组成的团队开始收集被诊断为RSV的患者的样本，并与麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的科学家分享，他们对病毒基因组进行了测序。他们想看看病毒的特征，比如新变种的出现，是否导致了激增的严重程度。

他们的分析，最初以预印本的形式发布medRxiv现在发表在新英格兰医学杂志的研究显示，RSV的多种谱系，而不是单一的、高度传播的变种，推动了病例的迅速上升。研究人员还发现，在大流行开始之前，这些血统就已经在传播了。

“这项研究真正的特别之处在于，我们的发现是如此清晰，我们能够如此迅速地做到这一点。在激增开始后的一两周内，我们就与麻省卫生医院的同事们一起工作，”布罗德传染病和微生物组项目的副成员、麻省卫生医院传染病科的医生研究员雅各布·勒米尤(Jacob Lemieux)说。

Lemieux与Broad研究所的科学家Bronwyn MacInnis和研究所成员Pardis Sabeti是这项研究的共同高级作者。

“当像这样的感染激增时，我们需要迅速采取行动基因数据从残留的诊断样本中提取，为公共卫生和临床领导者提供情报，帮助指导他们的应对措施，”麦金尼斯说。“如果我们研究的是一种具有高度传染性或威胁性的RSV变种，这将改变疫情的发展公共卫生理解并回应它。”

越野比较

当时，华盛顿大学的科学家已经对来自西雅图患者的2022年秋季疫情激增的唯一其他可用RSV基因组进行了测序。布罗德研究小组比较了来自华盛顿和马萨诸塞州的病毒基因组，发现了相似的基因特征和血统，揭示了相同的血统正在推动全国范围内的病毒激增。

“我认为我们都怀疑会有一个单一的RSV变种隐藏在激增，但当我们建立种系发生树但我们发现事实并非如此，”布罗德学院的博士后助理、该研究的共同第一作者盖奇·莫雷诺(Gage Moreno)说。

医学博士布列塔尼·彼得罗斯说:“在密切相关的RSV序列的系统发育集群中，存在显著的遗传多样性，这表明这些谱系在COVID-19大流行之前已经循环和进化了多年。”他是Sabeti实验室的学生，也是这项研究的共同第一作者。“这一发现进一步消除了一种新的RSV变种是导致这种激增的原因。”

科学家们提出了一些假设来解释病例激增的原因，这些假设与病毒关系不大，而与感染者关系更大。一项主要研究表明，COVID-19大流行期间的个人防护行为，如保持距离和戴口罩，可能会降低人群对RSV的接触和免疫力。特别是经常感染病毒的幼儿和其他幼儿，他们可能在2020年和2021年从未接触过RSV，现在的互动比大流行最严重时期更多。

Lemieux说，目前还不清楚这个假设是否正确，但他补充说:“我们能说的是，多个血统与这种激增有关，这真的很令人惊讶，而且似乎在美国各地都是这样。”

研究人员目前正在研究病毒和宿主免疫因子在RSV传播中的作用，以更好地了解病毒激增的原因。