量化肝细胞中乙型肝炎病毒库的新标准
![The effect of different DNA extraction methods on cccDNA quantification by qPCR and SB in HBV-infected USG mouse liver tissue. (A) Schematic presentation of the experimental design used for the cross-validation. (B) SB analysis on non-digested DNA extracts using HBV DNA probes in three of the labs. (C) qPCR measurements of total HBV DNA and cccDNA in the DNA extracts. Bars depict the median and range across all four labs. (D) qPCR measurements of cccDNA shown separately for every lab, relative to the amount in the +PK DNA extractions. Bars depict the mean of duplicate measurements. +PK, total DNA extraction with proteinase K digestion; −PK, total DNA extraction without proteinase K digestion; cccDNA, covalently closed circular DNA; HBV, hepatitis B virus; Hirt, Hirt DNA extraction, which does not include a proteinase K digestion; qPCR, quantitative PCR; SB, Southern blot. Credit: Gut (2023). DOI: 10.1136/gutjnl-2022-328380 量化肝细胞中乙型肝炎病毒库的新标准](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/new-standards-to-quant.jpg)
大约有3亿人慢性感染乙型肝炎病毒,这种病毒可导致肝硬化或癌症。因此,迫切需要开发HBV治疗方法。然而,由于HBV独特的复制策略,在临床前和临床研究中必不可少的被感染肝细胞中病毒DNA的量化在技术上是困难的,而且没有标准化。
由DZIF科学家领导的一个国际研究联盟现在制定了优化、控制和验证定量病毒DNA测量的建议,这可能对治疗策略的临床前和临床评估至关重要。
HBV是一种DNA病毒,专门感染人类肝细胞。感染后,病毒的DNA基因组被细胞酶转化为共价闭合环状DNA (cccDNA),与细胞染色体蛋白结合,在细胞核内形成稳定的迷你染色体。在这种形式下,病毒DNA充当了形成新病毒颗粒的模板。
临床前和临床HBV研究的一个主要限制是缺乏标准化的基于pcr的方法来特异性定量HBV感染样本中以cccDNA形式存在的病毒DNA。
作为国际消除乙型肝炎病毒联盟(ICE-HBV)支持的国际联盟的一部分,汉堡-埃彭多夫大学医学中心的DZIF科学家海德堡大学和慕尼黑工业大学与法国国家病毒研究机构hépatites virales (ANRS)和美国吉利德科学公司的同事合作,比较了方案,并制定了基于证据的最佳实践指导,以通过定量PCR量化cccDNA。
在比较不同的HBV DNA定量方案时组织样本“我们发现,不同形式的病毒DNA共存以及样本保存和处理条件强烈影响基于pcr的HBV cccDNA定量,”DZIF年轻研究员Lena Allweiss博士说,他领导了六个参与实验室的合作。基于研究结果,该团队为HBV cccDNA定量测量的优化、控制和验证制定了样本类型定制的方法建议。
“这项研究将有助于HBV治愈研究项目,旨在评估治疗对细胞HBV库的影响临床前研究和临床试验研究负责人、汉堡-埃彭多夫大学医学中心DZIF科学家莫拉·丹德里教授说。
更多信息:Lena Allweiss等人,乙型肝炎病毒cccDNA的定量:监测HBV治愈关键障碍的循证指南,肠道(2023)。DOI: 10.1136 / gutjnl - 2022 - 328380