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量化肝细胞中乙型肝炎病毒库的新标准

量化肝细胞中乙型肝炎病毒库的新标准
不同DNA提取方法对hbv感染USG小鼠肝组织cccDNA qPCR和SB定量的影响(A)用于交叉验证的实验设计示意图。(B)三个实验室使用HBV DNA探针对未消化的DNA提取物进行SB分析。(C) DNA提取物中HBV总DNA和cccDNA的qPCR检测。条形图描绘了这四个实验室的中位数和范围。(D)每个实验室分别显示cccDNA的qPCR测量,相对于+PK DNA提取的量。条形图描述了重复测量的平均值。+PK,蛋白酶K消化提取总DNA;−PK,不经蛋白酶K消化的总DNA提取;cccDNA,共价闭合环状DNA; HBV, hepatitis B virus; Hirt, Hirt DNA extraction, which does not include a proteinase K digestion; qPCR, quantitative PCR; SB, Southern blot. Credit:肠道(2023)。DOI: 10.1136 / gutjnl - 2022 - 328380

大约有3亿人慢性感染乙型肝炎病毒,这种病毒可导致肝硬化或癌症。因此,迫切需要开发HBV治疗方法。然而,由于HBV独特的复制策略,在临床前和临床研究中必不可少的被感染肝细胞中病毒DNA的量化在技术上是困难的,而且没有标准化。

由DZIF科学家领导的一个国际研究联盟现在制定了优化、控制和验证定量病毒DNA测量的建议,这可能对治疗策略的临床前和临床评估至关重要。

HBV是一种DNA病毒,专门感染人类肝细胞。感染后,病毒的DNA基因组被细胞酶转化为共价闭合环状DNA (cccDNA),与细胞染色体蛋白结合,在细胞核内形成稳定的迷你染色体。在这种形式下,病毒DNA充当了形成新病毒颗粒的模板。

临床前和临床HBV研究的一个主要限制是缺乏标准化的基于pcr的方法来特异性定量HBV感染样本中以cccDNA形式存在的病毒DNA。

作为国际消除乙型肝炎病毒联盟(ICE-HBV)支持的国际联盟的一部分,汉堡-埃彭多夫大学医学中心的DZIF科学家海德堡大学和慕尼黑工业大学与法国国家病毒研究机构hépatites virales (ANRS)和美国吉利德科学公司的同事合作,比较了方案,并制定了基于证据的最佳实践指导,以通过定量PCR量化cccDNA。

在比较不同的HBV DNA定量方案时“我们发现,不同形式的病毒DNA共存以及样本保存和处理条件强烈影响基于pcr的HBV cccDNA定量,”DZIF年轻研究员Lena Allweiss博士说,他领导了六个参与实验室的合作。基于研究结果,该团队为HBV cccDNA定量测量的优化、控制和验证制定了样本类型定制的方法建议。

“这项研究将有助于HBV治愈研究项目,旨在评估治疗对细胞HBV库的影响研究负责人、汉堡-埃彭多夫大学医学中心DZIF科学家莫拉·丹德里教授说。

更多信息:Lena Allweiss等人,乙型肝炎病毒cccDNA的定量:监测HBV治愈关键障碍的循证指南,肠道(2023)。DOI: 10.1136 / gutjnl - 2022 - 328380

期刊信息: 肠道

由Deutsches Zentrum提供für Infektionsforschung
引用:量化肝细胞中乙型肝炎病毒库的新标准(2023年,2月6日)检索于2023年4月17日从//www.puressens.com/news/2023-02-standards-quantify-hepatitis-virus-reservoirs.html
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