新技术识别罕见肿瘤细胞“间谍”

香港科技大学(科大)的研究人员开发了一种新技术，可以在冷冻和新鲜组织的单细胞中同时进行基因组DNA和RNA测序，并通过这种方法识别出伪装成正常细胞的罕见脑肿瘤细胞“间谍”。这一突破促进了一些最复杂和罕见肿瘤的癌症研究，为未来药物靶点的发现开辟了新的方向。

基因组DNA和RNA测序对于确定癌症的治疗至关重要，因为它提供了关于肿瘤基因组和分子组成或细胞异质性的重要信息，而细胞异质性会影响疾病病理以及肿瘤产生耐药性的能力。

我们目前关于癌症的知识还不能完全解释为什么肿瘤会复发或对治疗产生耐药性;通过观察DNA和RNA在高分辨率下探索肿瘤组成的新维度可能会提供答案。然而，现有技术在同时进行DNA和RNA测序方面的适用性有限单个细胞来自冷冻的生物组织，然而这些冷冻组织构成了大多数现成的临床癌症样本。

现在，科大生命科学部、化学与生物工程系副教授吴安琪教授及其博士后研究员余磊博士领导的团队，开发了一种新的多功能单细胞多组学分析技术scONE-seq，可以分析冷冻细胞和难以获得的细胞类型，如骨骼和大脑。这种新方法还可以通过一锅反应同时收集肿瘤中的基因组和转录组信息。

星形细胞瘤是一种致命的侵袭性脑肿瘤，患有这种类型肿瘤的患者在诊断疾病后5年内的存活率仅为5%左右。利用他们新的单细胞技术，该团队在患者的星形细胞瘤样本中发现了一个小而独特的肿瘤细胞亚群。

这种独特的肿瘤群体伪装成正常的大脑星形胶质细胞，可以逃避其他常用肿瘤测序方法的检测。此外，这种“间谍”肿瘤细胞还表现出与耐药性相关的分子特征;这种“间谍”肿瘤细胞在肿瘤进展中的全面作用将是未来研究该病和可能的药物靶点的重要方向。

Wu说:“通过识别以前的方法可能遗漏并导致治疗无效的罕见肿瘤细胞，scONE-seq方法代表了发现药物靶点和开发新药的新途径。我们计划继续我们的工作，使用scONE-seq来分析更大的患者群体，并希望在未来有更多的临床转化结果。”

这项研究发表在该杂志上Zenodo．