确定艾滋病毒在大脑中的睡眠位置
![Microglia HIV-1 ISs map to introns of highly transcribed genes recurrently targeted in T cells(A) Normalized chromosomal distribution of the integration events for CD4 + T cells, MDMs, and microglia. Integration density is calculated for each cell type as the number of integrations per chromosome per total number of integrations divided by chromosome length.(B) Bar plot showing the percentage of ISs falling into promoters (microglia, 20.1%; MDMs, 25.7%; CD4 + T cells, 20.2%; from the transcription start site [TSS] to 2 kb upstream), 3′ UTRs (microglia, 2%; MDMs, 2.4%; CD4 + T cells, 2.3%), 5′ UTRs (microglia, 0.1%; MDMs, 0.1%; CD4 + T cells, 0.14%), exons (microglia, 1.9%; MDMs, 2.5%; CD4 + T cells, 1.6%), introns (microglia, 60.2%; MDMs, 56.3%; CD4 + T cells, 57.2%), downstream (microglia, 0.9%; MDMs, 1.1%; CD4 + T cells, 0.9%; from the transcription end site [TES] to 3 kb downstream), and distal intergenic regions (microglia, 14.5%; MDMs, 11.7%; CD4 + T cells, 17.3%).(C) Shared integrations in CD4 + T cells, MDMs, and microglia. Shown is a comparison of the genes between CD4 + T cells (n = 5,199), MDMs (n = 750), and microglia (n = 2,719) with at least one integration in their gene bodies.(D) Bar plot representing the percentage of genic ISs according to their expression levels determined by RNA-seq into high, mid, low, or no expressed genes in microglia and CD4 + T cells compared with the global gene expression levels in each cell type. Credit: Cell Reports (2023). DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112110 艾滋病毒在大脑中沉睡的位置](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2023/where-hiv-sleeps-in-th-1.jpg)
人类免疫缺陷病毒HIV-1能够感染人体的各种组织。一旦进入细胞,病毒将其基因组整合到细胞基因组中,并建立持久感染。宿主基因组的结构和组织在HIV-1感染中的作用尚不清楚。
利用基于大脑免疫小胶质细胞的细胞培养模型,由海德堡大学医院和德国感染研究中心(DZIF)的科学家领导的一个国际研究小组现在确定了HIV-1在大脑中的插入模式基因组小胶质细胞。
感染了人类免疫缺陷病毒(HIV)在99.9%的病例中仍然是不治之症。这是因为病毒在受感染细胞的基因组中保持长时间的休眠状态,使其不可见,病毒无法进入免疫系统还有抗病毒药物。HIV-1隐藏在宿主细胞基因组中的途径主要是在血液CD4+ T细胞中研究的,CD4+ T细胞是病毒的主要靶细胞。
然而,HIV-1能够感染不同器官中的其他免疫细胞,在那里它建立了稳定的宿主。大脑就是这样一个病毒庇护所,病毒主要感染小胶质细胞免疫细胞,经常引起神经炎症和HIV-1相关神经认知障碍(HAND)的症状。
与HIV-1感染和大脑复制相关的问题一直很难解决,因为对患者的研究在监测大脑中病毒的能力方面受到限制。来自海德堡大学医院的Marina Lusic博士领导的一个国际团队和DZIF现在成功地在人类小胶质细胞培养中开发了hiv -1感染模型。
该模型的建立首次允许研究HIV-1基因组插入小胶质细胞的基因组。基因组插入导致病毒基因组沉默,导致所谓的“睡眠病毒”表型。
研究人员最近发表了他们的研究结果细胞的报道他们利用小胶质细胞模型确定HIV-1整合位点,并将其与染色质的结构和调控元件相关联。
“模拟大脑中的hiv -1感染免疫细胞通过小胶质细胞培养,我们发现细胞染色质因子和睡眠病毒表型之间存在更强的相关性,”该论文的第一作者莫娜·莱茵伯格说。
“这种蛋白质被称为CTCF,是细胞基因组中最重要的结构蛋白之一,参与细胞内染色质的折叠和包装。我们的研究结果表明,CTCF正在塑造HIV-1基因组插入谱小神经胶质细胞,从而导致潜伏感染状态。”
Lusic博士总结说:“这些细胞培养模型的研究对于了解病毒如何在身体的不同部位靶向非常重要,即使在目前的治疗方案下,病毒也可以隐藏在那里或引起神经系统疾病。”
更多信息:Mona Rheinberger等人,小胶质细胞中HIV-1整合的基因组分析将病毒整合与拓扑相关域联系起来,细胞的报道(2023)。DOI: 10.1016 / j.celrep.2023.112110