研究发现，omicron变体之间增强的重组有助于病毒免疫逃逸

2022年1月，就在SARS-CoV-2的欧米克隆变体开始迅速传播的时候，印度科学研究所(IISc)微生物与细胞生物学系助理教授Shashank Tripathi领导的一个研究小组注意到，欧米克隆变体的重组菌株数量出现了异常高的增长。

研究小组分析了所有病毒株出现在2019年11月至2022年7月之间的全球各种数据库中。在一项发表在医学病毒学杂志在美国，他们发现了几个新的突变，这些突变通过高速率的重组积累起来，并产生了影响病毒蛋白特别是病毒刺突蛋白的不同部分(结构域)。

这些结构域，如受体结合结构域(RBD)和N端结构域(NTD)，已知参与病毒-宿主结合，也被报道为宿主免疫系统的攻击位点。研究小组表明，在这些突变的帮助下，一些这样的omicron重组和突变菌株能够逃脱宿主的防御，并更紧密地结合到细胞上宿主细胞．

他们的观察为越来越多的证据提供了证据，证明新病毒株在逃避免疫攻击和引起感染方面是多么有效。

众所周知，像SARS-CoV-2这样的病毒会不断变化，这使得我们的免疫系统很难识别和摧毁它们。这是生产疫苗时的一个主要问题。的遗传物质在SARS-CoV-2中是一个长单链RNA。此外，在这种病毒中，复制这种RNA-RNA聚合酶所需的蛋白质是容易出错的。

Tripathi解释说，病毒可以通过两种机制之一进化:突变或重组。“这是一种增加基因多样性的策略。”聚合酶不仅允许突变积累，它还经常导致不同病毒株之间发生重组。当存在联合感染时，这是可能的——当宿主细胞被一种以上的病毒株感染时。

“当复制病毒RNA时，聚合酶可以从一个RNA模板跳到附近的另一个，”特里帕蒂说。如果附近的序列是另一个菌株的序列，那么新的副本将是两个亲本菌株的重组或杂交。特里帕蒂说，目前有超过35种SARS-CoV-2的重组。他解释说，例如，2022年出现的更高效的变种之一XBB，是由其他两个版本的欧米克隆基因重组而来。

根据这项研究，这些重组事件的增加有两个可能的原因。首先，在2022年欧微米波期间，感染和合并感染的数量很高。其次，研究小组注意到病毒基因中出现了一种核酸外切酶的特定突变，核酸外切酶是一种可以切割RNA的蛋白质，据信与重组有关。特里帕蒂解释说:“我们的研究结果表明，随着突变的发生，病毒并没有冷却，而是在升温。”

因为增强复合研究人员说，通过定期对病毒进行测序来跟踪这种重组是至关重要的。