年龄相关性黄斑变性的新研究发现因果基因,消除之前的假设

研究中心领导的一项研究在南旧金山,基因泰克发表在细胞基因组学寻找药物靶点,可以解决年龄相关性黄斑变性(AMD),一个条件的中心视力问题全球2亿人。AMD会导致失明。

摘要“系统生物学方法揭示了小说在年龄相关性黄斑变性疾病的机制,”研究人员描述了他们的步骤来识别基因通道通过治疗的分子图谱AMD病理学发展阶段。

研究鉴定了23个重要的全基因组中不同的甲基化位点AMD。超过1000个差异表达基因被发现在疾病阶段和不同的Muller细胞州AMD-affected眼睛。这项研究强调了因果基因upregulations AMD和潜在的遗传风险。

研究人员生成bulk-tissue和单细胞转录组和表观基因组学数据从85年独特的人类捐献的眼睛了解分子发生随着AMD的发展变化。他们分析了组织转录组早期、中间和两种类型的AMD晚期。

研究的一个有趣的发现是穆勒的不同集群神经胶质细胞states-basal, AMD和gliotic。总共62%的基底穆勒集群来自控制,和80%的AMD穆勒集群来自AMD的捐赠者。这项研究的作者指出,尽管穆勒神经胶质过多症是一种常见的功能视网膜疾病穆勒和伤害,AMD集群没有显示神经胶质过多症的高表达标记(调节胶质原纤维酸性蛋白)。实际中观察到人类疾病状态不同于视网膜损伤模型常用于AMD转化研究。

研究还指出,gliotic穆勒状态之间似乎是一个关键的中间正常神经胶质和视网膜再生干细胞的身份。这表明视网膜再生研究转化为治疗策略,更深入地理解疾病状态的穆勒神经胶质是必要的,作为潜在的治疗旨在重组基底或gliotic穆勒可能不是适合AMD-like状态。

分析之间的控制和AMD捐赠者没有发现全基因组显著差异。没有明显的差异控制在细胞类型和AMD样本或亚型水平。

相比先前的研究约翰•霍普金斯大学的研究人员在2018年“ATAC-Seq分析揭示了一个广泛的减少年龄相关性黄斑变性的染色质易访问性”发表在自然通讯,AMD疾病状态被发现降低全球开放染色质,基因泰克公司的研究人员没有发现相应的染色质易访问性的转变。

基于之前报道的观察,目前的研究将观察疾病相关的差异染色质易访问性更高分辨率的细节。然而,当前的研究并没有看到一个复制的先前的研究发现染色质易访问性的转变在全球范围内或在特定位点,这表明染色质易访问性的变化在过去的大部分分析可能是由于细胞死亡在样本混杂non-disease-related细胞核的细胞类型。

基因泰克公司的研究人员,以及与同事从犹他大学和纽约州立大学布法罗分校,消除了一些过去的假设和混淆研究尝试和发现了一个健壮的相关基因机制与AMD的数量可能会形成未来的研究的基础。

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