一个liquid-biopsy-based multicancer早期检测测试可以发现早期疾病和低DNA-shedding癌症
液体biopsy-based multicancer早期检测(mc)测试可以检测12类型的癌症,包括低DNA-shedding癌症和早期癌症,根据一个回顾性研究的数据AACR年会202314 - 19,举行4月。
“检测癌症在早期筛查项目已被证实能拯救生命。然而,只有少数癌症放映可用的今天,绝大多数的癌症死亡来自癌症没有筛选方法,“说主持人本Ho公园,医学博士,博士本杰明·f·伯德Jr .)肿瘤学教授Vanderbilt-Ingram癌症中心主任和教授医学血液学和肿瘤学分部的范德比尔特大学医学中心。
Blood-based mc测试是在开发的早期检测的多种癌症类型相同血液样本。然而,早期疾病和癌症的检测了少量的cfDNA进入血液仍然是具有挑战性的。“最大限度地实现对病人的影响结果,mc测试将需要展示强烈的早期癌症检测和检测能力范围广泛的癌症,”公园补充道。
异常的DNA甲基化是一个癌症发展的关键驱动因素,公园解释道。“不同的甲基化模式存在癌和非癌细胞之间。此外,还有共同的甲基化模式在癌症类型,以及不同组织特定的甲基化区域。因此,mc方法适用于基于甲基化检测癌症和预测的组织起源的癌症,”派克说。
公园和他的同事正在评估一种新颖的全基因组methylome浓缩平台捕获甲基化DNA (cfDNA)游离分子没有化学或酶治疗,血液循环使测序整个methylome而不需要整个基因组序列,从而使它具有成本效益和保护cfDNA的质量。
作者进行了一项回顾性病例对照研究来评估这个平台的能力来检测12个癌症一群大约有4000人,其中包括新诊断的患者,首次治疗癌症和年龄——例非肿瘤控制的准确性。大约50%的癌症病例早期阶段(阶段I和II)。初步分析交叉验证的研究人员报道,发现在1903个样本的一个子集训练队列来评估性能的机器学习算法的设计将从控制情况下,使用训练和测试样本的80%和20%,分别。
性能评估的措施被称为曲线下的面积(AUC),这估计准确测试能够区分癌症和非癌,1分代表完美的歧视。
在这个初始开发研究,测试可以检测癌症的AUC 0.94所有癌症类型和阶段。值得注意的是,mc平台的性能区分阶段I和II癌症控制仍然很高,分别为0.92和0.95的AUC,。
个别癌症的auc检测从0.89到0.99不等。性能也高low-shedding癌症(包括膀胱、乳房、肾、前列腺癌、子宫内膜癌),,结合,是杰出的AUC 0.91。
”这个平台允许更高的信噪比,提高性能在更具挑战性的应用cfDNA负担是最低的。癌症,摆脱大量的cfDNA最佳性能,但即使是癌症,通常很难发现cfDNA化验检测与高性能临时读出,”派克说。“在发展的早期阶段,早期的健壮的检测和low-shedding癌症全基因组methylome浓缩平台非常有前途。”
作者称,该研究报告的主要限制是它利用从多个生物银行获得的样本。“可能会有一些混杂因素通过生物或人口可能会限制的性能测试在这项研究中,“说公园。他还指出,这是一个早期发展研究中,需要进一步的研究来证实这些发现和血液测试前准备使用在临床设置。
此外,平台的性能在患者回顾性评估新诊断癌症和非匹配癌症控制。“需要验证结果的前瞻性研究,”派克说。
