肺癌的分子特性阐明免疫治疗反应
最新的一类型的癌症药物,免疫疗法称为免疫抑制剂检查站,改变了过去decade-dramatically提高肺癌的治疗一些病人的生存与这种疾病最常见的非小细胞肺癌(NSCLC)。然而,只有20%的患者经历了从这些免疫疗法中获益。
一项新的研究由麻省理工和哈佛大学的研究人员和马萨诸塞州总医院(MGH)揭示了关键肺肿瘤的分子特性,这些特性可以解释为什么有些病人当别人不应对这些治疗。团队发现一些基因和其他生物因素这可能影响非小细胞肺癌患者免疫疗法的反应,抑制PD-1或PD-L1蛋白质。
发表在自然遗传学,这项工作是第一个站起来Cancer-Mark基金会的联合分析队列,一个大数据集聚集通过多努力扩大分子了解非小细胞肺癌的治疗反应。
研究小组检查了whole-exome测序和RNA-sequencing肿瘤样本的数据由近400名非小细胞肺癌患者治疗之前,连同他们的临床反应anti-PD信息- (L) 1治疗。这是一个最大的multi-omic数据集从非小细胞肺癌患者接受这些药物,使科学家们能够识别一套与改善治疗结果相关的分子特性。
这些结果表明生物因素的复杂性,确定免疫治疗的反应,并建议为什么现有的方法预测非小细胞肺癌患者的治疗结果,只看少量的分子特性,并不总是准确的。研究人员说他们的研究指出,潜在的改善这些预测甚至发展更多的个性化治疗方法基于病人的分子。
“现在,一些病人的长期疾病控制仅仅是可以实现的,”解释了文章的第二作者贾斯汀Gainor,中心主任胸癌症在MGH和哈佛医学院副教授(HMS)。“这癌症和免疫生物学的分析提供了一个更深的理解,我们希望可以利用为更广泛的人口使这些疗法有效。这种合作还在继续增长,这将进一步增加我们的理解相关的分子变化。”
“这项工作还演示了合作的重要性,使聚合数据从大群病人,“迦得盖茨补充道,协会成员在广泛和教员HMS和MGH。“总的来说,我们的目标是为这个丰富的带注释的数据集作为一个有用的资源领域,超越我们的第一个分析。”
“我们希望肿瘤突变和分层基因表达模式将提供原则和机械的假设基础免疫疗法,通过这种方式,鼓励特定机械的研究,”Nir Hacohen解释说,协会成员广泛和癌症免疫学在MGH中心主任。
领导的工作是另外co-first作者阿文德•拉维,马修·张春和莫妮卡Arniella Broad研究所,丹娜-法伯癌症研究所,纪念斯隆凯特林癌症中心。
构建分子概要文件
PD-1 / PD-L1免疫检查点是一种蛋白质相互作用通常会抑制免疫系统。癌细胞使用这种逃避身体的防御机制。Anti-PD - (L) 1代理工作通过阻断这种交互,刺激免疫系统的攻击癌症细胞。
研究小组着手全面概要这在患者样本分子景观。在他们的发现,他们发现禁用特定基因改变dna修复基因的ATM和免疫疗法与有利的反应。他们还发现基因组变化可能会增加叔基因的表达,这与消极的结果。,他们发现了另一个关键因素的表达基因编码某些immunoproteasome子单元。
通过整合临床、基因组和转录组的数据,研究人员发现了两个总体特征的集合,与良好的治疗反应:“免疫激活/疲惫”环境,在免疫细胞显示签名以前高活动减弱;和高水平的neoantigens定义的一个签名,或者外国蛋白质显示在肿瘤细胞的表面。
第三个超级“伤口愈合”微环境,的免疫系统出现抑制,类似于如何行为的早期治疗相关的物理损伤对治疗的反应不利。
团队另外发现第四个“其他”类别,混合的签名与治疗结果相关的正面和负面。
“这些特性可以提供能力分层患者以更微妙的方式,”拉维解释道。“我们发现病人你会对治疗反应良好基于传统预测实际上可能反应不佳,由于额外的不利因素的存在,并不是通常在常规临床护理评估。理解这个复杂的架构将继续是至关重要的我们研究如何改善结果所有病人。”
更多信息:Arvind Ravi et al,基因组和转录组分析的检查点封锁响应在晚期非小细胞肺癌,自然遗传学(2023)。DOI: 10.1038 / s41588 - 023 - 01355 - 5