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单细胞RNA序列映射在小鼠同种异体心脏移植免疫细胞异质性

单细胞RNA序列映射在小鼠同种异体心脏移植免疫细胞异质性
RNA单细胞测序的免疫细胞在淋巴结显示11细胞集群的存在。答:整个研究设计的方案。单细胞RNA序列应用于免疫细胞的淋巴结来源于小鼠心脏移植,和输出数据被用于表达分析。b . t-SNE投影7967单一免疫细胞(每个点代表一个细胞)从同源的心脏移植小鼠淋巴结分享相似的转录组的概要文件,按颜色分组根据无监督聚类的结果。c .集群映射中定义的每个集群显示分配的身份(B)。d .热图分析与已知的基因表达谱的T细胞,B细胞,DC细胞,NK细胞,nuocytes。大肠十大调节度(排名由日志褶皱变化)的免疫细胞,每个集群绘制的热图。外:我。t-SNE地图显示选择的表达的细胞标记细胞数量确定为(F), T细胞(G), B细胞(H)、直流电池,(I), NK细胞。信贷:心血管的创新和应用程序(2023)。DOI: 10.15212 / CVIA.2023.0023

免疫细胞发挥着重要作用在调节心脏移植后异体排斥和宽容。然而,免疫细胞异质性在单细胞水平和免疫细胞状态如何影响移植免疫,仍不完全的特征。

一项新研究的作者,发表在心血管的创新和应用程序,进行单细胞RNA序列(scRNA-seq)从一只老鼠LNs同源的和同种异体心脏移植模型。9 T细胞通过无监督方法确定集群。通路富集分析被用来探索功能细胞亚种群之间的区别和描述代谢T细胞的异质性。

免疫细胞的转录景观是确定,尤其是T细胞,和它们的代谢在LNs转录组心脏移植。分子和功能性质的基础上,我们还发现了T细胞类型与transplantation-associated免疫过程,包括细胞毒性CD8+传统的CD4 T细胞,激活+T细胞和功能失调的亚群。的贡献JunB Th17的感应和限制Treg发展进一步阐明,作者发现,HIF-1a参与T细胞的代谢和功能。

第一个系统的单细胞分析T细胞内的转录变异人口呈现在这篇文章中,为新药的开发提供新的见解的同种异体移植物排斥反应。

更多信息:中华通et al,单细胞RNA序列映射在小鼠同种异体心脏移植免疫细胞异质性,心血管的创新和应用程序(2023)。DOI: 10.15212 / CVIA.2023.0023

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引用:单细胞RNA序列映射在小鼠同种异体心脏移植免疫细胞异质性(2023年5月25日)检索2023年7月4日从//www.puressens.com/news/2023-05-single-cell-rna-sequencing-immune-cell.html
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