高潮的项目共享数据的安全药物

eTRANSAFE,欧洲项目共享数据的安全药物,已经结出果实。在一个平台上,该项目已经集成数据来自10000多个药理研究参考制药公司,从十几个数据库,积聚公共和私人信息的临床和临床前研究。该项目还开发了“火焰”,一个开源的机器学习的应用程序,允许预测未来的药物是否会有不良影响。

eTRANSAFE项目涉及到13制药公司和一打学术机构,包括格丽;医学生物信息学的研究项目UPF的医学和生命科学(梅丽莎),医院德尔研究所和剥离MedBioinformatics解决方案,这源于同一个程序。

“共享数据的顺序。在学术界,开放数据是相对常见的但在商业世界更为复杂,”弗兰Sanz解释道,UPF值教授和综合生物医学信息学研究小组的协调员格丽。“然而,由于药品安全不是主要区域的能力制药行业共享数据的可能性是更可行的,因此eTRANSAFE诞生了。从共享数据的机会,需要能够更好地预测未来药物的毒性,”Sanz补充道,他是学术项目的协调员。

eTRANSAFE项目,结果发表在《华尔街日报》自然评论药物发现、收集信息来自10000多个毒理学研究由13个基准制药公司,如拜耳、罗氏、勃林格。收集的数据和其他数据从公共数据库,已经进入ToxHub平台;创建一个独特的系统,使所有项目成员可以探索和利用药品安全信息。

该财团已经标准化的数据收集临床前研究在动物身上进行,临床和药物警戒的研究,在人类中,提取电子以减少人为错误。然而,为了所有的结果相比,该财团不得不开发计算机服务标准化的“翻译”发表在临床前和临床的概念开放获取。

“当我们看到抓挠行为在动物实验中,我们应该将它与在诊所,我们称之为瘙痒。因此我们需要一个工具来将这些概念和能够比较的结果在动物和人类研究,”Sanz解释道。

联合分析的临床前和临床研究发现,并不总是最接近人类的动物是最适合预测药物在我们物种的影响。例如,老鼠被发现为预测比灵长类动物皮肤反应,可以引起的激酶抑制剂,广泛用于癌症治疗的药物。

这个项目的框架内,格丽已经开发了火焰,一个应用程序简单地构建、维护和共享模型,预测新化合物的生物属性。”这个应用程序,在几分钟内我们能共享一个模型与制药公司大学,”解释了Manuel牧师,UPF值教授和格丽Pharmacoinformatics集团的负责人,领导发展的火焰。

应用程序,它可以安装在一台笔记本电脑和大云服务器”提供了在一个简单的和视觉吸引力的方式非常复杂的软件,因此,任何人员可以使用它”。

项目已经持续了六年,也被用来研究虚拟原型控制动物,和与合作伙伴的合作,如MedBioInformatics解决方案,开发生物信息学工具来识别机械生物标记,提供的信息机制药物引起的副作用,和文本挖掘工具来识别生物标志物在临床试验中使用。

所有这些工具和数据库开发的eTRANSAFE将永久地存储在UPF值,这是项目的最后一个“诚实的中间人”。

”项目取得的许多目标开始,并成为可能与制药公司建立直接联系,并根据自己的实际需要开发产品”的结论是劳拉·弗朗格丽联合创始人和科学主任剥离,MedBioinformatics解决方案。